Πολλά προβλήματα (τα οποία συσσωρεύονται εδώ και πολλά χρόνια) αντιμετωπίζει το 5ό Νηπιαγωγείο Κισάμου.
Συγκεκριμένα, το κτιριακό πρόβλημα δεν έχει λυθεί εδώ και χρόνια με αποτέλεσμα όταν ξεκινήσουν οι βροχές και πάλι το Νηπιαγωγείο να βάζει νερά και να έχει υγρασία.
Παρόλο που οι εκπαιδευτικοί κάνουν υπεράνθρωπες προσπάθειες οι γονείς δεν προτιμάνε να στέλνουν τα παιδιά τους στο Νηπιαγωγείο με αποτέλεσμα πλέον να έχει μόνο 20 παιδάκια.